Pouco antes de ser queimado, Huss teria dito aos seus carrascos: Vocês hoje estão queimando um ganso (Huss significa "ganso" na língua boêmia), mas dentro de um século, encontrar-se-ão com um cisne. E este cisne vocês não poderão queimar. Normalmente os estudiosos identificam Martinho Lutero com este cisne da profecia de John Huss que 102 anos depois pregou suas 95 teses em Wittenberg.
No momento em precedeu a sua execução, Huss fez uma oração sincera pedindo a Deus que perdoasse seus inimigos, mas a oração foi recebida como escárnio. Em seguida, foram-lhe arrancadas suas vestes sacerdotais, e puseram - lhe na cabeça uma mitra de papel onde se viam pintados três demônios em contraposição as três pessoas da Trindade: Pai, Filho e o Espírito Santo. O cálix sacerdotal, que lhe tinha sido colocado nas mãos, foi-lhe tirado com estas palavras: Maldito Judas, que, tendo abandonado o conselho da paz, entraste no dos judeus, arrancamos-te das mãos este santo cálix onde está o sangue de Cristo. Ao que Huss respondeu: Pelo contrário, confio que pela graça de Deus ainda hoje hei de beber dele no Seu Reino. Os bispos retrucaram: Nós entregamos a tua alma aos demônios do inferno. Neste momento, Huss orou ao Senhor dizendo: E eu entrego o meu espírito nas tuas mãos, oh Senhor Jesus Cristo. A ti entrego a alma que tu salvaste!
Minutos antes de ser queimado em uma fogueira as autoridade eclesiásticas tentaram fazer com que Huss assinasse uma retratação. Veja qual foi sua resposta: Tudo o que escrevi e assinei foi com o fim de livrar as almas do poder do Demônio, e livrá-las da tirania do pecado; e sinto alegria em selar como o meu sangue o que escrevi e assinei.
Dito isto, John Huss, que não teve a sua vida por preciosa, foi para o encontro do seu SENHOR!